Записи с меткой «наука и техника»

04.12.2020

Компания Parseq Lab (Санкт-Петербург) при сотрудничестве с ФГБУ «НИИ гриппа им А.А. Смородинцева» Минздрава России разработала первую отечественную тест-систему для секвенирования полного генома коронавируса SARS-Cov-2.

фото: Следить за мутациями – с первой отечественной тест-системой для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2

Высокотехнологичное решение позволит наблюдать за изменениями генома вируса и оперативно реагировать на них. Разработка проводилась в рамках Российского консорциума по секвенированию геномов коронавирусов (CoRGI).

По всему миру продолжают выявлять случаи заражения вирусом SARS-CoV-2, вызывающим COVID-19. Когда вирус активно распространяется, он непрерывно мутирует – поэтому ключевую роль в борьбе играют научные исследования. Ведь изменения генома вируса оказывают прямое влияние как на эффективность создаваемых вакцин и используемых методов диагностики и лечения, так и на его вирулентность и трансмиссивность. Контролировать ситуацию помогут грамотный мониторинг генетических изменений и своевременная передача данных в общую международную базу EpiCoV GISAID.

фото: Следить за мутациями – с первой отечественной тест-системой для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2

На сегодняшний день стандартным способом диагностики COVID-19 остаётся метод полимеразной цепной реакции (ПЦР). В ходе ПЦР нарабатываются специфические короткие участки вирусного генома – таким образом можно определить присутствует ли в исследуемом образце вирус. Высокоспецифичные ПЦР тест-системы были разработаны благодаря данным, полученным в результате расшифровки генома возбудителя методом секвенирования. Способ позволяет определять последовательность нуклеотидов в геноме вируса, что делает высокопроизводительное секвенирование нового поколения (NGS, MPS) незаменимым методом для исследования изменчивости SARS-CoV-2.

фото: Следить за мутациями – с первой отечественной тест-системой для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2

Секвенирование генома вируса является важной прикладной задачей: так, в 2020 году Центр по контролю и профилактике заболеваний СШАвыделил на поддержку программы секвенирования SARS-CoV-2 почти 9 миллионов долларов. Кроме финансовой поддержки, центр официально рекомендовал использовать метод для подтверждения случаев повторного заражения.

В России исследования геномов коронавируса также проводятся – в рамках Российского консорциума по секвенированию геномов коронавирусов. Объединение было создано летом 2020 года по инициативе ФГБУ «НИИ гриппа им А.А. Смородинцева» Минздрава России. Сегодня данные собираются из 36 регионов России и добавляются в международную базу данныхEpiCov GISAID.

Среди наиболее популярных и часто используемых протоколов секвенирования – ARTIC Network. Однако из-за того, что протокол опирается на реагенты зарубежных производителей с длительными сроками поставки, существенно страдает оперативность проведения подобных исследований. К тому же ARTIC Network несовершенен – глубина покрытия генома SARS-CoV-2 зачастую оказывается неравномерной, что снижает качество данных о некоторых областях.

«Тест-система Parseq Lab за счет использования большего количества более коротких ампликонов по сравнению с ARTIC Network позволяет добиться более равномерного покрытия генома. Следует отметить, что на запуск с одним и тем же объемом данных тест-система Parseq Lab позволяет проанализировать больше образцов», – отмечает Андрей Комиссаров, заведующий лабораторией молекулярной вирусологии ФГБУ «НИИ гриппа им А.А. Смородинцева» Минздрава России.

При разработке новой тест-системы компания Parseq Lab ставила цель максимально покрыть геном вируса SARS-Cov-2 и стандартизировать анализ данных. Для этого необходимо было создать набор реагентов и разработать специальное программное обеспечение для обработки данных. В поиск решения включились молекулярные генетики, биоинформатики и программисты. Итогом стала новая тест-система VariFind™ SARS-Cov-2 assay, которая была опробована на базе ФГБУ «НИИ гриппа им А.А. Смородинцева». Новое высокотехнологичное решение показало практически полное и равномерное покрытие всего генома вируса и позволило в 2 раза увеличить количество одновременно анализируемых образцов, сократив временные затраты на анализ.

Для работы с геномом SARS-Cov-2 было решено использовать адаптированное программное обеспечение (ПО) VariFind™ Software. Ранее его использовали в тест-системах Parseq Lab для анализа данных генома человека. За это время программное обеспечение показало себя качественным и надёжным. VariFind™ Software позволяет выравнивать результаты секвенирования на референсный геном изолята Wuhan-Hu-1 и обнаруживать мутации в исследуемых образцах. ПО поможет существенно облегчить труд учёных по обработке данных и подвести анализ под единые алгоритмы и стандарты. Такое решение должно поспособствовать внедрению секвенирования нового поколения геномов SARS-CoV-2 в различные научные и диагностические учреждения и лаборатории России.

Смотрите также:
08.04.2020

В Санкт-Петербурге стартует уникальный онлайн-курс по принципиально новым методам управления робототехническими устройствами «Динамическое манипулирование: неполноприводные механические системы. Современные методы планирования, представления, обучения и управления движением»

Владимир Трофименко – руководитель российского представительства компании компании Mankiewicz и член стратегического совета по инвестициям в новые индустрии при Минпромторге РФ рассказал о запуске уникального онлайн-курса для молодых ученых, студентов старших курсов, магистров и инженеров-разработчиков технологических предприятий в Санкт-Петербурге.  

Санкт-Петербург, 07 апреля 2020. 

На совместном заседании президиума Госсовета и Совета по науке и образованию 6 февраля 2020 года, под председательством Владимира Владимировича Путина, обсуждалась необходимость новых подходов к образованию и новых способов организации обмена знаниями, которые создали бы возможность технологического прорыва для страны. Требуется создать кадровый задел с новыми компетенциями.

Санкт- Петербургская общественная организация содействия развитию профессионально — личностных качеств «Люди Будущего», в рамках проекта «Платформа для проведения обучения и исследований, лабораторно-исследовательский комплекс «Робот Бабочка», представила образовательный курс по программе «Динамическое манипулирование: Неполноприводные механические системы. Современные методы планирования, представления, обучения и управления движением», разработанный специалистами ГК “Роботикум”. Партнерами проекта выступили Университетская Точка Кипения СПбПУ Петра Великого, Центры компетенций НТИ,, Университет 20.35, Кружковое движение НТИ

Материалы курса будут доступны бесплатно всем зарегистрированным на курс участникам.

Новый онлайн-курс для молодых ученых, студентов старших курсов, магистров и преподавателей ведущих ВУЗов страны (участие подтвердили более 40 университетов) и инженеров-разработчиков технологических компаний позволит вывести научные и корпоративные процессы в робототехнике на новый уровень. По словам автора курса, всемирно известного в мире робототехники ученого Антона Ширяева, курс направлен на обсуждение задач поиска, представления и управления вынужденными движениями неполноприводных механических систем. Особенностью таких робототехнических систем является наличие одной или нескольких степеней свободы, динамика которых не может быть изменена напрямую приводом (внешней силой или моментом), и их поведение определяется лишь за счет динамики оставшихся координат. В рамках курса формируется система знаний, необходимая для постановки, исследования и решения указанных задач робототехники. 

“На сегодняшний день не смотря на те фантазии, которые зачастую рисуют в информационном поле, сферы применения робототехнических устройств и их возможности крайне ограничены. В основном это бесконтактные операции сварки и окрашивания, а также операции с жестким захватом по координате. Авторы курса — разработчики и владельцы международного патента на принципиально новые методы управления стандартными распространенными манипуляторами. Данный подход позволит значительно расширить сферы применения роботов. Мы говорим о возможности создания методов управления, которые позволят роботам-манипуляторам совершать контактные операции — шлифование (например, компрессорной лопатки авиационного двигателя, от которой зависит целая отрасль), контактное окрашивание и другие производственные операции — на первом этапе, и роботизированные хирургические операции, уход за людьми с ограниченными возможностями и многое другое — в ближайшей перспективе. Новая математика также применима в автономном движении и других перспективных отраслях. Мы говорим о принципиально новой технологической парадигме в робототехнике”, – говорит Владимир Трофименко.

Для иллюстрации теоретического материала предлагается детальный анализ примеров по планированию и управлению манипуляционных движений тел рукой робота при неудерживающем контакте.

К участникам курса предъявляются довольно высокие требования: они должны владеть английским языком на уровне В2, а также обладать знанием основ аналитической механики, теории устойчивости, теории управления и теории дифференциальных уравнений, а также иметь начальный опыт программирования в MatLab и C++.

“Содержание курса отражает современные тенденции робототехники и может быть рекомендовано для включения в магистерские программы обучения по специальностям мехатроника, робототехника, механика и прикладная математика”, – комментирует Александр Формальский – доктор физико-математических наук, профессор НИИ механики МГУ им. М.В. Ломоносова.

Курс стартовал с 06 Апреля на youtube-канале Агрегатора технологических проектов Общественной организации “Люди будущего” www.youtube.com/c/peoplefuture

Подробная инормация о курсе на сайте https://leader-id.ru/event/43150/

Объем учебной программы рассчитан на 20 часов на русском и английском языках.

Материалы будут появлятся по мере готовности лекций.

Контактное лицо по образовательному курсу и лабораторным установкам нового поколения “Робот-бабочка”:

Роман Усатов-Ширяев 

[email protected]

+7 (921) 403-97-12

Об общественной организации «Люди будущего» 

Санкт-Петербургская общественная организация содействия развитию профессионально-личностных качеств «Люди будущего» создает современное и полностью открытое пространство для развития навыков и подготовки специалистов. Миссия организации – создание сообщества людей, которое будет нацелено на развитие яркой индивидуальности каждого человека, а также реализацию его талантов в конкретных современных проектах. Агрегатор оригинальных и уникальных технологических стартапов с потенциальной доходностью свыше 1:300.

http://people-future.com

О компании Mankiewicz:

Mankiewicz (Манкевич) — международная индустриальная группа компаний, основанная в Гамбурге в 1895 г. Сегодня представлена в 17 странах на пяти континентах. В 2013 году фирма открыла официальное представительство в России и странах СНГ. Компания входит в ТОП-100 инновационных компаний Германии, является лучшим работодателем Гамбурга 2019 и обладает серебряной медалью EcoVadis 2019. 

Mankiewicz – ведущий разработчик и производитель индустриальных систем, полимерных антикоррозионных и защитно-декоративных покрытий, специальных лакокрасочных материалов и технологий их нанесения. Международно признанный партнер ведущих производителей в авиастроении, автомобилестроении, ветрогенерации, общем машиностроении, ж/д машиностроении и судостроении. 

Компания Mankiewicz активно внедряет методики искусственного интеллекта, роботизации и Design of Experiments в разработке сложной химической продукции. Входит в список «скрытых чемпионов». В настоящее время Mankiewicz – разработчик и производитель антибактериальных покрытий нового поколения. Представительства компании расположены на 5 континентах. Численность сотрудников Манкевич по всему миру насчитывает более 1 500 человек, а товарооборот — 380 млн евро в год.

https://www.mankiewicz.com/russian/home/ 

Онлайн 

Смотрите также:
  • Интересно

    Кто виноват и что делать? — ответы на самые важные вопросы!

  • Книги по бизнесу

    • "Разумный инвестор. Полное руководство по стоимостному инвестированию" Грэм Бенджамин - Мировой бестселлер, выдержавший множество переизданий по всему миру, книга Бенджамина Грэма (1394-1976) является уникальным пособием по выстраиванию инвестиционной политики. Автор, всемирно известный экономист и авторитетный профессиональный инвестор, главное внимание уделяет не анализу ценных бумаг, а принципам инвестирования, предлагая действовать разумно и осторожно независимо от поведения фондового рынка.

    • "Переиграть Уолл-стрит" Питер Линч - куда выгоднее вкладывать деньги — в акции или облигации? Как выбрать лучшие акции, которые станут победителями на рынке? Как правильно читать баланс и финансовые отчеты компании, чтобы получить максимум информации для принятия решения? Что нужно учитывать при выборе взаимного фонда? Как обогнать рынок? Эти и множество других вопросов профессионально и доходчиво обсуждаются автором, сумевшим превратить историю своего 13-летнего управления фондом в остроумное и увлекательное повествование.

    • "Финансовая отчетность для руководителей и начинающих специалистов" Герасименко Алексей - в этой книге шаг за шагом рассматриваются вопросы составления и интерпретации финансовой отчетности предприятия. Все концепции раскрываются на примерах из реальной отчетности крупных российских компаний. Используя богатый практический опыт, автор раскрывает все нюансы финансовой отчетности, в том числе и специфические «западные» вопросы составления отчетности по МСФО.

    • "Настольная книга финансового директора" Брег С. -эта книга является не только превосходным учебником, но и полным справочником для финансовых директоров практически по всем аспектам их повседневной работы. Главное достоинство книги - ее практическая направленность.

Банки | Бизнес | Второе гражданство | Закон | Как заработать в интернете | Купить остров | Недвижимость | Новости бизнеса | Оффшоры | Стиль жизни | Страны мира

| | | |
Реклама:


Business Key Top Sites